น้ำที่เป็นพิษส่วนมากจะมี แอมโมเนียและไนไตรท์มากเกินไป โดยปกติไม่ควรตรวจสอบสารนี้เลย หรืออาจจะกำหนดให้ค่าที่ตรวจพบไม่เกินกว่า 0.1 ส่วนในล้านที่ภาษาวิทยาศาสตร์เรียกหน่อยนี้ว่า พีพีเอ็ม (ppm) สารพิษนี้เกิดจากขบวนการของสิ่งมีชีวิตในตู้ปลา รวมทั้งตัวปลาด้วย ดังนั้นปริมาณสารพิษจะเพิ่ม ตลอดเวลา
 การเปลี่ยนถ่ายน้ำคือวิธีหนึ่ง ที่ใช้ควบคุมปริมาณสารพิษนี้ การกรองด้วยเครื่องกรองก็เป็นการรวบร่วมสารพิษเหล่านี้ไว้ในที่ที่เหมาะสม เพื่อทำลายหรือเปลี่ยนไปเป็นสารที่ไม่อันตรายโดยพืชหรือจุลินทรีย์ ดังนั้นการเติมจุลินทรีย์ ดังนั้นการเติมจุลินทรีย์  RQ. ไบโอพลัสอย่างสม่ำเสมอจะช่วยลดปัญหาการมีสารพิษมากเกินไป หากพบมาสารมาก และอยู่ในน้ำนานๆ จะมีผลโดยตรงต่อสุขภาพปลา และเป็นสาเหตุหลักที่ทำให้เกิดโรคในที่สุด ดังนั้นจึงไม่ควรให้สารพิษในน้ำมากกสรตรวจสอบ และ การแก้ไขด้วยการเปลี่ยนน้ำ หรือการเติมจุลทรีย์จะเป็นวิธีการแก้ปัญหาที่ดีที่สุด